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Starvio siRNA轉染實驗指南--細胞密度

細胞密度對于siRNA轉染實驗的影響是很大的。通常情況下,轉染試劑成功轉染siRNA的細胞會使得目標基因表達下調(diào),但未成功轉染的細胞卻不受影響,這時轉染效率和總的細胞數(shù)量就顯得十分重要,密度過高或過低都會影響轉染效果:

 一般細胞數(shù)量較少時,轉染效率高,但是一些轉染試劑由于本身毒性的影響,細胞數(shù)量太低時毒性就變得明顯,導致細胞死亡率也高,所以得到的轉染效果并不可靠;

 較多的細胞數(shù)量則會導致細胞過度接觸和聚集在一起,這會減少轉染試劑和siRNA到達單個細胞的機會,從而降低轉染效率;并且,較高的細胞密度也可能導致細胞代謝活性下降,從而影響siRNA的敲除效率。

因此,在進行細胞轉染實驗時,需要根據(jù)轉染試劑和細胞類型等因素來優(yōu)化細胞密度,以提高轉染效率和減少干擾。我們建議在使用Starvio siRNA轉染試劑進行轉染時,細胞密度控制在30-50%之間,考慮到細胞增殖的問題,在轉染前一天鋪板時的細胞密度一般為25%左右。如果使用24孔板進行培養(yǎng),細胞數(shù)一般為每孔4*104個,具體數(shù)量可根據(jù)細胞增殖快慢進行調(diào)整。如果要使用較大的培養(yǎng)板,可在此基礎上調(diào)整細胞鋪板數(shù),如12孔培養(yǎng)板,每孔可接種細胞數(shù)8*104個,建議實驗者在此基礎上進行適當?shù)膬?yōu)化實驗以選擇最佳細胞接種數(shù)量。

此外,siRNA的轉染和DNA的轉染不一樣,DNA的轉染是過量表達,死亡一些細胞對過量表達的蛋白本身來說影響不大,但siRNA的轉染,死亡的細胞所有的基因表達(包括特定目標基因)都下降,將與siRNA造成的特定目標基因的表達下降現(xiàn)象是一致的,將大大影響實驗結果,因此選用低細胞毒性的轉染試劑也非常重要。目前,普通轉染試劑的主要成分為脂質(zhì)體或聚乙烯亞胺(PEI),這兩種成分都具有很大的細胞毒性,所以要求的細胞密度也較高,而Starvio siRNA采用的是新型可降解納米材料,毒性很低,只需要30-50%的細胞密度就可進行轉染,實驗者可放心按照說明書進行,切勿帶入常規(guī)轉染試劑的細胞密度要求進行實驗。

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