影響siRNA轉(zhuǎn)染實驗效果的因素有各種各樣,或是轉(zhuǎn)染時細胞密度不合適、或是轉(zhuǎn)染試劑量多了、又或是siRNA濃度偏低了等等,可以說轉(zhuǎn)染實驗總在你意想不到的細節(jié)處或者某個小決定之后開始走向失敗。其實,想要把這種失敗的損失和概率降到最低,聰明的科研者一定會進行實驗條件的摸索,看似花了額外的時間,但是卻能有事半功倍的效果。這里,非常建議,尤其是對于首次轉(zhuǎn)染的同學(xué),請選擇24孔板進行條件摸索!主要有以下理由:
1、能夠摸索出最優(yōu)實驗條件
每個細胞都有自己的“個性”,有的增殖比較快,有的增殖比較慢,而siRNA轉(zhuǎn)染試劑所要求的轉(zhuǎn)染密度是一個最適范圍,如毒性很低的Starvio siRNA轉(zhuǎn)染試劑只需要細胞密度在30-50%即可轉(zhuǎn)染,而lipo3000則要求細胞密度為70-90%。當你不確定用多少細胞數(shù)鋪板才能達到轉(zhuǎn)染實驗所需的合適密度時,就可以用24孔板接種不同數(shù)量的細胞以摸索出最佳的細胞接種數(shù),如分別接種3.5*104、4*104、4.5*104個細胞。這樣一來,對于不同種類的細胞就可以知道哪個接種量能夠在轉(zhuǎn)染時達到需要的最適密度,并且如果以上接種數(shù)皆能達到轉(zhuǎn)染密度,也可以比較出最優(yōu)條件,即能夠使轉(zhuǎn)染效率達到最高的接種數(shù)。
又比如科研者可以通過24孔板設(shè)置不同的轉(zhuǎn)染試劑量、siRNA濃度來摸索最適條件,雖然說明書確實只提供了一種在實驗室條件下普遍能夠轉(zhuǎn)染出很好效果的比例,但對于不同實驗,不一定是最優(yōu)答案。每一個研究者都希望實驗?zāi)軌蜃龀鲎詈玫男Ч?,那這些條件的摸索是必不可少的!
2、兼顧成本與轉(zhuǎn)染效率檢測
大家或許疑惑為什么不能用大孔板拿來進行條件摸索呢,這方面考慮到很多實驗者只是初次轉(zhuǎn)染或者只是想通過小包裝來試用,那么24孔板是一種能夠同時兼顧成本以及轉(zhuǎn)染效率檢測的選擇。
所謂“成本”,并不只是指在試劑和耗材上的消耗,還有研究者的精力與時間成本??梢哉f,做細胞實驗,往往從培養(yǎng)細胞開始就需要花費研究者很多的時間與精力,實驗試劑的開銷比起做定量、核酸提取更是昂貴了許多。因此,在正式實驗開始前,利用24孔板來摸索實驗條件是非常明智的,不僅可以最大程度地節(jié)約試劑使用量,也不影響實驗結(jié)果的檢測,如RT-qPCR等?;蛟S有同學(xué)存在疑問,24孔板培養(yǎng)的細胞數(shù)是否能夠提取出足量的RNA進行qPCR檢測?這個問題不用擔心,只要是質(zhì)量正常的RNA提取試劑,提取的RNA量完全可以滿足qPCR檢測的需要。
常常有同學(xué)在購買轉(zhuǎn)染試劑小包裝后直接上六孔板進行試驗,不是一種可取的做法。小包裝中的試劑量本來就少,用六孔板或更大的培養(yǎng)皿進行條件優(yōu)化或?qū)嶒灻?,很容易在實驗成功之前就將試劑消耗完畢。既浪費了試劑,又耽擱了時間,建議待實驗條件固定后,再進行較大孔板的轉(zhuǎn)染實驗。
總之,希望大家不要怕麻煩,成功前的每一步都不是偶然!摸索實驗條件的最優(yōu)解也是每個實驗者必備的科研素養(yǎng)哦~